第69回天皇杯全日本サッカー選手権大会（だい69かいてんのうはいぜんにほんサッカーせんしゅけんたいかい）は、1989年（平成元年）12月9日から1990年（平成2年）1月1日まで開かれた天皇杯全日本サッカー選手権大会である。
概要 本大会出場は32チーム。
出場チーム 日本サッカーリーグ1部 古河電工（25回目） 日立製作所（24回目） ヤンマーディーゼル（22回目） NKK（18回目） フジタ工業（18回目） 本田技研（16回目） 読売クラブ（15回目） ヤマハ発動機（13回目） 日産自動車（12回目） 東芝（9回目） 松下電器（9回目） 全日空サッカークラブ（4回目）
北海道 札幌マツダ（初出場）
東北 TDK（4回目）
関東 三菱重工（25回目） 筑波大学（14回目） 明治大学（9回目） 順天堂大学（2回目） 東海大学（2回目） 読売ジュニア（初出場）
北信越 YKK（3回目）
東海 コスモ石油（6回目） 藤枝市役所（3回目） PJMフューチャーズ（初出場）
関西 田辺製薬（15回目） 京都紫光クラブ（9回目） NTT関西（7回目） 大阪ガス（2回目）
中国 マツダ（38回目）
四国 大塚製薬（2回目）
九州 新日本製鐵（33回目） 三菱化成黒崎（3回目）
試合 1回戦 日産自動車 3-1 東海大学 コスモ石油 0(PK2-0)0 三菱重工 本田技研 4-3 筑波大学 札幌マツダ 1-4 ヤンマーディーゼル 読売クラブ 4-0 大阪ガス 三菱化成黒崎 2-5 日立製作所 新日本製鐵 1-0 京都紫光クラブ 大塚製薬 1-2 フジタ工業 ヤマハ発動機 5-1 読売ジュニア PJMフューチャーズ 5-0 TDK 東芝 1-0 NTT関西 順天堂大学 1-0 古河電工 松下電器 0-1 マツダ 田辺製薬 1-2 NKK 明治大学 4-2 YKK 藤枝市役所 0-2 全日空サッカークラブ
2回戦 日産自動車 4-0 コスモ石油 本田技研 1-3 ヤンマーディーゼル 読売クラブ 1-0 日立製作所 新日本製鐵 1-3 フジタ工業 ヤマハ発動機 1-0 PJMフューチャーズ 東芝 3-0 順天堂大学 マツダ 1-0 NKK 明治大学 0-3 全日空サッカークラブ
準々決勝 日産自動車 1-0 ヤンマーディーゼル 読売クラブ 1-0 フジタ工業 ヤマハ発動機 2-1 東芝 マツダ 1-2 全日空サッカークラブ
準決勝 日産自動車 1-0 読売クラブ ヤマハ発動機 1(PK4-2)1 全日空サッカークラブ
決勝 日産自動車 3-2 ヤマハ発動機
関連項目 1989年-1990年のJSL 第14回JSLカップ